La lotta microbiologica si effettua con preparati a base di agenti patogeni [E1] [E2] [F1] [SP1].
I preparati a base di virus vengono distribuiti per infettare gli insetti fitofagi, in genere allo stadio larvale, provocandone la morte. In Italia questa tecnica è ancora in fase di studio anche se esistono Paesi in cui i preparati virali registrati sono applicati nella lotta in campo.
La lotta con batteri viene effettuata con preparati a base di batteri entomopatogeni. Un esempio molto noto è quello del Bacillus thuringensis [E1] [E2] [F1] [SP1] che ha avuto un discreto successo nella lotta contro i Lepidotteri defogliatori.
La lotta biologica utilizza, inoltre, nematodi parassitoidi (gen. Steinernema) ed in via sperimentale i funghi.
Fig.17 Preparato a base di Bacillus thuringiensis